| fastp version: | 1.1.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (289 cycles) |
| mean length before filtering: | 183bp |
| mean length after filtering: | 183bp |
| duplication rate: | 18.560355% (may be overestimated since this is SE data) |
| total reads: | 15.588333 M |
| total bases: | 2.854302 G |
| Q20 bases: | 2.836913 G (99.390759%) |
| Q30 bases: | 2.797828 G (98.021412%) |
| Q40 bases: | 1.512877 G (53.003380%) |
| GC content: | 62.528394% |
| total reads: | 12.692193 M |
| total bases: | 2.323256 G |
| Q20 bases: | 2.307342 G (99.315025%) |
| Q30 bases: | 2.273653 G (97.864923%) |
| Q40 bases: | 1.229489 G (52.920932%) |
| GC content: | 62.458333% |
| reads passed filters: | 15.585062 M (99.979016%) |
| reads with low quality: | 259 (0.001661%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 1.458000 K (0.009353%) |
| reads with low complexity: | 1.554000 K (0.009969%) |
| reads with adapter dimer: | 0 (0.000000%) |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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