| fastp version: | 1.1.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (289 cycles) |
| mean length before filtering: | 180bp |
| mean length after filtering: | 180bp |
| duplication rate: | 16.577848% (may be overestimated since this is SE data) |
| total reads: | 15.054155 M |
| total bases: | 2.724715 G |
| Q20 bases: | 2.707559 G (99.370334%) |
| Q30 bases: | 2.669012 G (97.955632%) |
| Q40 bases: | 1.471446 G (54.003668%) |
| GC content: | 60.794108% |
| total reads: | 12.555121 M |
| total bases: | 2.271272 G |
| Q20 bases: | 2.255419 G (99.302036%) |
| Q30 bases: | 2.221632 G (97.814428%) |
| Q40 bases: | 1.225394 G (53.951892%) |
| GC content: | 60.709185% |
| reads passed filters: | 15.050407 M (99.975103%) |
| reads with low quality: | 227 (0.001508%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 1.632000 K (0.010841%) |
| reads with low complexity: | 1.889000 K (0.012548%) |
| reads with adapter dimer: | 0 (0.000000%) |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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