| fastp version: | 1.1.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (289 cycles) |
| mean length before filtering: | 163bp |
| mean length after filtering: | 162bp |
| duplication rate: | 15.497964% (may be overestimated since this is SE data) |
| total reads: | 17.612113 M |
| total bases: | 2.872541 G |
| Q20 bases: | 2.860093 G (99.566653%) |
| Q30 bases: | 2.829200 G (98.491184%) |
| Q40 bases: | 1.873717 G (65.228555%) |
| GC content: | 59.791960% |
| total reads: | 14.879331 M |
| total bases: | 2.422776 G |
| Q20 bases: | 2.411302 G (99.526409%) |
| Q30 bases: | 2.384147 G (98.405575%) |
| Q40 bases: | 1.582197 G (65.305125%) |
| GC content: | 59.688163% |
| reads passed filters: | 17.608439 M (99.979139%) |
| reads with low quality: | 127 (0.000721%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 1.762000 K (0.010004%) |
| reads with low complexity: | 1.785000 K (0.010135%) |
| reads with adapter dimer: | 0 (0.000000%) |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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