| fastp version: | 1.1.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (289 cycles) |
| mean length before filtering: | 178bp |
| mean length after filtering: | 178bp |
| duplication rate: | 15.625746% (may be overestimated since this is SE data) |
| total reads: | 14.050683 M |
| total bases: | 2.508885 G |
| Q20 bases: | 2.495019 G (99.447315%) |
| Q30 bases: | 2.462622 G (98.156026%) |
| Q40 bases: | 1.407670 G (56.107368%) |
| GC content: | 61.432757% |
| total reads: | 11.853207 M |
| total bases: | 2.113458 G |
| Q20 bases: | 2.100640 G (99.393524%) |
| Q30 bases: | 2.072136 G (98.044814%) |
| Q40 bases: | 1.186925 G (56.160344%) |
| GC content: | 61.354643% |
| reads passed filters: | 14.048539 M (99.984741%) |
| reads with low quality: | 174 (0.001238%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 834 (0.005936%) |
| reads with low complexity: | 1.136000 K (0.008085%) |
| reads with adapter dimer: | 0 (0.000000%) |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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