| fastp version: | 1.1.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (289 cycles) |
| mean length before filtering: | 170bp |
| mean length after filtering: | 170bp |
| duplication rate: | 15.405015% (may be overestimated since this is SE data) |
| total reads: | 15.715071 M |
| total bases: | 2.682117 G |
| Q20 bases: | 2.669254 G (99.520422%) |
| Q30 bases: | 2.638517 G (98.374409%) |
| Q40 bases: | 1.635244 G (60.968420%) |
| GC content: | 61.573372% |
| total reads: | 13.292095 M |
| total bases: | 2.265696 G |
| Q20 bases: | 2.253801 G (99.475035%) |
| Q30 bases: | 2.226693 G (98.278554%) |
| Q40 bases: | 1.382350 G (61.012151%) |
| GC content: | 61.490773% |
| reads passed filters: | 15.712805 M (99.985581%) |
| reads with low quality: | 161 (0.001024%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 666 (0.004238%) |
| reads with low complexity: | 1.439000 K (0.009157%) |
| reads with adapter dimer: | 0 (0.000000%) |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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