| fastp version: | 1.1.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (289 cycles) |
| mean length before filtering: | 171bp |
| mean length after filtering: | 171bp |
| duplication rate: | 15.222420% (may be overestimated since this is SE data) |
| total reads: | 14.018507 M |
| total bases: | 2.403540 G |
| Q20 bases: | 2.391001 G (99.478345%) |
| Q30 bases: | 2.361444 G (98.248592%) |
| Q40 bases: | 1.447171 G (60.210013%) |
| GC content: | 61.501878% |
| total reads: | 11.881859 M |
| total bases: | 2.035414 G |
| Q20 bases: | 2.023781 G (99.428465%) |
| Q30 bases: | 1.997620 G (98.143140%) |
| Q40 bases: | 1.225462 G (60.207025%) |
| GC content: | 61.416466% |
| reads passed filters: | 14.015547 M (99.978885%) |
| reads with low quality: | 185 (0.001320%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 1.070000 K (0.007633%) |
| reads with low complexity: | 1.705000 K (0.012162%) |
| reads with adapter dimer: | 0 (0.000000%) |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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