| fastp version: | 1.1.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (189 cycles) |
| mean length before filtering: | 146bp |
| mean length after filtering: | 146bp |
| duplication rate: | 21.945891% (may be overestimated since this is SE data) |
| total reads: | 20.119033 M |
| total bases: | 2.943294 G |
| Q20 bases: | 2.915790 G (99.065529%) |
| Q30 bases: | 2.870152 G (97.514957%) |
| Q40 bases: | 1.039660 G (35.323011%) |
| GC content: | 47.827857% |
| total reads: | 15.692153 M |
| total bases: | 2.292341 G |
| Q20 bases: | 2.267325 G (98.908727%) |
| Q30 bases: | 2.230293 G (97.293261%) |
| Q40 bases: | 811.039648 M (35.380412%) |
| GC content: | 47.699576% |
| reads passed filters: | 20.103928 M (99.924922%) |
| reads with low quality: | 204 (0.001014%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 1.344000 K (0.006680%) |
| reads with low complexity: | 13.557000 K (0.067384%) |
| reads with adapter dimer: | 0 (0.000000%) |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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