| fastp version: | 1.1.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (189 cycles) |
| mean length before filtering: | 139bp |
| mean length after filtering: | 139bp |
| duplication rate: | 20.635969% (may be overestimated since this is SE data) |
| total reads: | 8.706487 M |
| total bases: | 1.217837 G |
| Q20 bases: | 1.209553 G (99.319765%) |
| Q30 bases: | 1.192078 G (97.884848%) |
| Q40 bases: | 481.745955 M (39.557505%) |
| GC content: | 62.129865% |
| total reads: | 6.907357 M |
| total bases: | 966.055105 M |
| Q20 bases: | 958.619997 M (99.230364%) |
| Q30 bases: | 944.044948 M (97.721646%) |
| Q40 bases: | 381.488528 M (39.489313%) |
| GC content: | 62.052872% |
| reads passed filters: | 8.703718 M (99.968196%) |
| reads with low quality: | 130 (0.001493%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 1.124000 K (0.012910%) |
| reads with low complexity: | 1.515000 K (0.017401%) |
| reads with adapter dimer: | 0 (0.000000%) |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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