| fastp version: | 1.1.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (189 cycles) |
| mean length before filtering: | 133bp |
| mean length after filtering: | 133bp |
| duplication rate: | 18.255694% (may be overestimated since this is SE data) |
| total reads: | 16.458761 M |
| total bases: | 2.205055 G |
| Q20 bases: | 2.194033 G (99.500158%) |
| Q30 bases: | 2.168012 G (98.320070%) |
| Q40 bases: | 990.864419 M (44.936043%) |
| GC content: | 60.089989% |
| total reads: | 13.450731 M |
| total bases: | 1.799643 G |
| Q20 bases: | 1.789787 G (99.452336%) |
| Q30 bases: | 1.767827 G (98.232077%) |
| Q40 bases: | 810.733556 M (45.049677%) |
| GC content: | 59.967553% |
| reads passed filters: | 16.454915 M (99.976633%) |
| reads with low quality: | 70 (0.000425%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 2.312000 K (0.014047%) |
| reads with low complexity: | 1.464000 K (0.008895%) |
| reads with adapter dimer: | 0 (0.000000%) |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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