| fastp version: | 1.1.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (189 cycles) |
| mean length before filtering: | 139bp |
| mean length after filtering: | 139bp |
| duplication rate: | 19.713680% (may be overestimated since this is SE data) |
| total reads: | 11.066427 M |
| total bases: | 1.544068 G |
| Q20 bases: | 1.533371 G (99.307234%) |
| Q30 bases: | 1.511046 G (97.861353%) |
| Q40 bases: | 614.840764 M (39.819535%) |
| GC content: | 62.893108% |
| total reads: | 8.881818 M |
| total bases: | 1.238962 G |
| Q20 bases: | 1.229315 G (99.221360%) |
| Q30 bases: | 1.210563 G (97.707817%) |
| Q40 bases: | 492.757619 M (39.771801%) |
| GC content: | 62.794882% |
| reads passed filters: | 11.062997 M (99.969005%) |
| reads with low quality: | 116 (0.001048%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 1.459000 K (0.013184%) |
| reads with low complexity: | 1.855000 K (0.016762%) |
| reads with adapter dimer: | 0 (0.000000%) |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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